More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0387 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
515 aa  1075    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03315  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  71.48 
 
 
519 aa  717    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0601  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  66.87 
 
 
512 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002673  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  72.77 
 
 
502 aa  716    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0152  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  60.43 
 
 
504 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
504 aa  595  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.469076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4000  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  60.43 
 
 
504 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  60.04 
 
 
499 aa  593  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03277  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)-binding  58.56 
 
 
501 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0288  FAD dependent oxidoreductase  59.61 
 
 
501 aa  588  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0288  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.56 
 
 
501 aa  589  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.33 
 
 
495 aa  588  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.56 
 
 
501 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.166207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4642  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.39 
 
 
502 aa  588  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03229  hypothetical protein  58.56 
 
 
501 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3623  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.56 
 
 
501 aa  589  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4734  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.35 
 
 
501 aa  587  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3902  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.56 
 
 
501 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.14 
 
 
501 aa  585  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.389691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3348  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.93 
 
 
509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.78 
 
 
512 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.78 
 
 
512 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.52 
 
 
512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.47 
 
 
547 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3834  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.1 
 
 
502 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.867048 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3718  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.1 
 
 
502 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3896  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.1 
 
 
502 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.758553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3727  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.1 
 
 
502 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3793  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.1 
 
 
502 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.3143  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4534  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.35 
 
 
512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443601  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3835  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.4 
 
 
502 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0230057  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4129  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.28 
 
 
500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.53 
 
 
500 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.26 
 
 
508 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.23 
 
 
509 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1073  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.42 
 
 
514 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0288  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.05 
 
 
499 aa  559  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.01 
 
 
510 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1114  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.21 
 
 
512 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2106  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.88 
 
 
501 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1827  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54 
 
 
513 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.17112  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.49 
 
 
512 aa  510  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.02 
 
 
516 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.71 
 
 
507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.35 
 
 
514 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.58 
 
 
510 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.71 
 
 
507 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1143  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.89 
 
 
500 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50 
 
 
509 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5335  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.91 
 
 
504 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2385  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.17 
 
 
513 aa  463  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.76 
 
 
503 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.55 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.35 
 
 
557 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0094  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.5 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.98 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.74 
 
 
504 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1361  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.17 
 
 
516 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.6 
 
 
503 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.6 
 
 
504 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.13 
 
 
509 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3045  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.22 
 
 
525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.399591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.68 
 
 
500 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0639  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.13 
 
 
509 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.37 
 
 
509 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4393  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.89 
 
 
527 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0420  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.41 
 
 
511 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.738036 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.08 
 
 
503 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46 
 
 
502 aa  448  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.49 
 
 
502 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.36 
 
 
513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2980  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.54 
 
 
525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3531  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.8 
 
 
534 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.959942  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.69 
 
 
502 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.49 
 
 
511 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.62 
 
 
531 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.94 
 
 
526 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.86 
 
 
517 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.12 
 
 
525 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0082196  normal  0.374558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3233  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.17 
 
 
502 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.700391  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0630  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  44.8 
 
 
531 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146837  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.39 
 
 
513 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.93 
 
 
511 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.27 
 
 
510 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.27 
 
 
509 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2206  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.82 
 
 
526 aa  438  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.440136  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1208  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.4 
 
 
534 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.397297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.64 
 
 
500 aa  438  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2453  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.03 
 
 
510 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2990  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.32 
 
 
524 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.03 
 
 
510 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6005  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.24 
 
 
507 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0493014  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0726  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.03 
 
 
510 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125098  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4792  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.8 
 
 
505 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.703258 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2442  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.4 
 
 
502 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1240  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.28 
 
 
515 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0740  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.03 
 
 
510 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2372  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.03 
 
 
510 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.38 
 
 
507 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2705  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.03 
 
 
510 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>