More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0375 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0375  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 587 aa  1175    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  45.6 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  44.88 
 
 		 581 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  42.21 
 
 		 582 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 562 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2250  FAD dependent oxidoreductase  40.71 
 
 		 600 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.035515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1987  FAD dependent oxidoreductase  42.35 
 
 		 616 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.37 
 
 		 582 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1192  FAD dependent oxidoreductase  42.04 
 
 		 571 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 		 543 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.33 
 
 		 551 aa  206  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 591 aa  204  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 545 aa  204  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 550 aa  203  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 603 aa  200  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 556 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 572 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 552 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 582 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 567 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.89 
 
 		 585 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.25 
 
 		 503 aa  186  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 582 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 536 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.05 
 
 		 514 aa  183  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 516 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 576 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.33 
 
 		 509 aa  177  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.13 
 
 		 516 aa  177  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 578 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.89 
 
 		 510 aa  174  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.13 
 
 		 526 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.52 
 
 		 500 aa  173  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 574 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 546 aa  173  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 600 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.5 
 
 		 583 aa  172  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.62 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0601  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.74 
 
 		 512 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 581 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03315  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.27 
 
 		 519 aa  171  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 566 aa  171  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 547 aa  171  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 573 aa  170  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.42 
 
 		 567 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4129  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.13 
 
 		 500 aa  170  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.02 
 
 		 517 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 577 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.56 
 
 		 605 aa  169  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4534  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.6 
 
 		 512 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443601  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3348  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.9 
 
 		 509 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  29.23 
 
 		 545 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.75 
 
 		 510 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002673  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.66 
 
 		 502 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.1 
 
 		 499 aa  167  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 583 aa  167  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 533 aa  167  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.97 
 
 		 495 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.51 
 
 		 557 aa  167  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.91 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 573 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2574  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.87 
 
 		 495 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 639 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.38 
 
 		 512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.88 
 
 		 512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.68 
 
 		 509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 579 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 574 aa  163  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 534 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3233  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.57 
 
 		 502 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.700391  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 527 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 579 aa  163  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 575 aa  163  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.12 
 
 		 489 aa  163  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.45 
 
 		 503 aa  163  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.19 
 
 		 525 aa  162  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 532 aa  163  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 552 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0420  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.69 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0639  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.22 
 
 		 509 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.63 
 
 		 508 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.89 
 
 		 512 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 518 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.11 
 
 		 515 aa  161  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  30.2 
 
 		 517 aa  161  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.67 
 
 		 511 aa  161  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.75 
 
 		 503 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 579 aa  160  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 519 aa  160  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4642  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.11 
 
 		 502 aa  159  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.89 
 
 		 547 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 567 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.4 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.04 
 
 		 501 aa  159  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.389691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 562 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0288  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 543 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.04 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>