224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0012 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 
464 aa  935    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  99.14 
 
 
464 aa  931    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 
500 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 
473 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 
479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
478 aa  232  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
485 aa  226  9e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  30.79 
 
 
473 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
479 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
479 aa  216  8e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
478 aa  206  6e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  30.06 
 
 
479 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  30.06 
 
 
476 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.85 
 
 
476 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  28.87 
 
 
489 aa  200  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
496 aa  199  7e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.33 
 
 
503 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 
965 aa  179  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
576 aa  170  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  23.68 
 
 
511 aa  166  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 
493 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
491 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  26.51 
 
 
508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  22.32 
 
 
472 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  19.06 
 
 
464 aa  100  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  20.43 
 
 
465 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  30.21 
 
 
698 aa  94.4  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  21.86 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  21.27 
 
 
473 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  21.27 
 
 
473 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  20.57 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 
412 aa  67  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  27.23 
 
 
625 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  24.12 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 
394 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  26.32 
 
 
403 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  31.29 
 
 
408 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  31.29 
 
 
409 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  20.51 
 
 
396 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  22.93 
 
 
385 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  21.49 
 
 
374 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 
403 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  22.11 
 
 
383 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.6 
 
 
390 aa  59.7  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.13 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 
371 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  24.1 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  19.79 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  27.51 
 
 
409 aa  57.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  20.71 
 
 
960 aa  57.4  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  22.99 
 
 
427 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  19.67 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  21.65 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  21.5 
 
 
500 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  21.62 
 
 
373 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  18.02 
 
 
465 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  21.62 
 
 
373 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  21.99 
 
 
369 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  24.83 
 
 
375 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  21.62 
 
 
373 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  21.58 
 
 
373 aa  54.7  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
382 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  21.62 
 
 
373 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  21.62 
 
 
373 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  21.62 
 
 
373 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  21.62 
 
 
373 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  22.39 
 
 
407 aa  54.3  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  21.16 
 
 
500 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  23.12 
 
 
402 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  20.74 
 
 
371 aa  53.9  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 
369 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  21.99 
 
 
369 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  19.25 
 
 
390 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  20.21 
 
 
373 aa  53.5  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  23.12 
 
 
402 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 
442 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  19.9 
 
 
369 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  27.59 
 
 
427 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  20.94 
 
 
383 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  20.19 
 
 
372 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  20.79 
 
 
368 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 
400 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  21.39 
 
 
398 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 
395 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  19.9 
 
 
370 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  22.91 
 
 
397 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 
367 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  22.57 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  21.99 
 
 
366 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.704477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>