More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3607 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  70.35 
 
 		 472 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 473 aa  940    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  97.46 
 
 		 470 aa  915    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  81.5 
 
 		 465 aa  724    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 473 aa  940    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  81.5 
 
 		 461 aa  743    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  39.74 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  41.25 
 
 		 465 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 		 496 aa  276  8e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  33.12 
 
 		 489 aa  256  6e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 478 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 479 aa  252  9.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.04 
 
 		 503 aa  249  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  31.39 
 
 		 473 aa  240  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 965 aa  239  8e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 493 aa  230  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  37.47 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 479 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 480 aa  223  6e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 475 aa  222  9e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 494 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  32.3 
 
 		 511 aa  212  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 491 aa  196  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  26.01 
 
 		 508 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 576 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  31.17 
 
 		 437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  31.09 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  28.99 
 
 		 698 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 362 aa  114  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.3 
 
 		 373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 380 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 373 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.83 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.83 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.83 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 367 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.83 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.83 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  27.44 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  29.26 
 
 		 371 aa  107  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 368 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 366 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 374 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 364 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 406 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  26.87 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 368 aa  100  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 369 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 369 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 369 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 409 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.77 
 
 		 366 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 367 aa  98.2  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 366 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  28.07 
 
 		 368 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  27.39 
 
 		 368 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 400 aa  96.3  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 366 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 368 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 370 aa  93.6  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  28.03 
 
 		 409 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  25.51 
 
 		 552 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  25.63 
 
 		 404 aa  90.5  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  25.96 
 
 		 427 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  27.57 
 
 		 403 aa  89.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 368 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 376 aa  87.8  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 403 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 366 aa  87  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  25.35 
 
 		 402 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  25.07 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  24.38 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>