230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0012 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  99.14 
 
 		 464 aa  931    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  100 
 
 		 464 aa  935    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  33.61 
 
 		 500 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 473 aa  239  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 479 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 478 aa  229  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  31 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 478 aa  208  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  30.06 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.85 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.74 
 
 		 503 aa  201  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  30.06 
 
 		 480 aa  200  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 		 496 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  28.45 
 
 		 489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 484 aa  182  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  24.9 
 
 		 965 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 576 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  24.04 
 
 		 511 aa  166  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 493 aa  157  6e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 491 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  26.21 
 
 		 508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  22.32 
 
 		 472 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  19.57 
 
 		 464 aa  100  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  22.27 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  30.73 
 
 		 698 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  20.43 
 
 		 465 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  21.86 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  21.27 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  21.27 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  21.6 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  24.12 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  26.8 
 
 		 625 aa  64.7  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  31.29 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  23.19 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  26.32 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  25.13 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  22.93 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  22.55 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  22.11 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  22.9 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.13 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  20.77 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  21.82 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  27.51 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  20.65 
 
 		 960 aa  57.4  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  19.79 
 
 		 378 aa  57  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  22.16 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  21.65 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  22.16 
 
 		 373 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  22.11 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  22.16 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  22.16 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  22.16 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  22.16 
 
 		 373 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  22.16 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  19.95 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 369 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  21.5 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  20.49 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 369 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 		 369 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  20.74 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  21.4 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  18.02 
 
 		 465 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  23.12 
 
 		 402 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  22.39 
 
 		 407 aa  54.3  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  21.16 
 
 		 500 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  23.12 
 
 		 402 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  24.16 
 
 		 375 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  20.81 
 
 		 369 aa  53.5  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  19.25 
 
 		 390 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  20.21 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  25 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  20.79 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  23.49 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  21.2 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  21.39 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>