More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1678 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
464 aa  931    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  62.37 
 
 
396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  51.24 
 
 
465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  39.74 
 
 
473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  39.74 
 
 
473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  40.18 
 
 
470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  40.35 
 
 
472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  39.51 
 
 
461 aa  299  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  39.74 
 
 
465 aa  289  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
500 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 
485 aa  250  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 
479 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 
496 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 
479 aa  242  9e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.33 
 
 
503 aa  239  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 
479 aa  239  8e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
478 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
479 aa  236  7e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
484 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 
480 aa  233  6e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  30.51 
 
 
473 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  29.71 
 
 
489 aa  227  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 
965 aa  226  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
476 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  30.32 
 
 
476 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
493 aa  220  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
491 aa  218  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
473 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
475 aa  206  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  32.14 
 
 
511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  29.1 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
576 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  26.57 
 
 
508 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  29.18 
 
 
383 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  23.99 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
461 aa  119  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  31 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  29.33 
 
 
698 aa  118  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  32.1 
 
 
403 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  26.94 
 
 
399 aa  110  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 
400 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
374 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
371 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.65 
 
 
373 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.65 
 
 
373 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.65 
 
 
373 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.65 
 
 
373 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.37 
 
 
404 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
367 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.65 
 
 
373 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
373 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
368 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
373 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
369 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 
378 aa  106  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.8 
 
 
373 aa  106  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
369 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  29.52 
 
 
410 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
376 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  29.52 
 
 
410 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
407 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  25.27 
 
 
373 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
375 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
369 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
369 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
369 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  24.91 
 
 
402 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 
366 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
396 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
366 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  30.26 
 
 
396 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 
409 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  28.04 
 
 
397 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
364 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  27.12 
 
 
427 aa  100  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  19.06 
 
 
464 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  19.57 
 
 
464 aa  100  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  30.06 
 
 
427 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  26.45 
 
 
407 aa  99.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
369 aa  99.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  27.88 
 
 
625 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  24.54 
 
 
402 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  28.31 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  29.73 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  25.27 
 
 
404 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
364 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 
370 aa  97.8  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 
400 aa  97.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  28.04 
 
 
398 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 
364 aa  96.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
403 aa  96.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>