More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0293 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
491 aa  994    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  43.61 
 
 
476 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  42.94 
 
 
500 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.4 
 
 
476 aa  372  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  42.47 
 
 
478 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  40.65 
 
 
496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.96 
 
 
503 aa  352  8.999999999999999e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  41.63 
 
 
478 aa  345  8e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  39.92 
 
 
473 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  39.2 
 
 
493 aa  329  5.0000000000000004e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  39.32 
 
 
494 aa  329  6e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  39.67 
 
 
489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  39.45 
 
 
485 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  39.79 
 
 
480 aa  325  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  39.17 
 
 
479 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 
479 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  38.13 
 
 
479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 
479 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  36.65 
 
 
511 aa  302  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 
473 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 
484 aa  280  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  33.12 
 
 
965 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 
576 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  34.69 
 
 
508 aa  249  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 
475 aa  230  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.8 
 
 
472 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
464 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
461 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
470 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
465 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
473 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
473 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  31.9 
 
 
387 aa  187  4e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
465 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 
461 aa  177  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  26.57 
 
 
396 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  45.05 
 
 
698 aa  160  7e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
464 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  26.69 
 
 
464 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  25.45 
 
 
373 aa  123  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 
368 aa  123  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
362 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  24.48 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  28.09 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
378 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
367 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  25.2 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  25.2 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  25.2 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  25.2 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  26.51 
 
 
404 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.39 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.93 
 
 
373 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
373 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  25.14 
 
 
368 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 
372 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
371 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
380 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 
364 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 
367 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  23.98 
 
 
366 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  23.03 
 
 
437 aa  105  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 
407 aa  105  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  24.47 
 
 
416 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  25.91 
 
 
407 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  23.67 
 
 
416 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 
368 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
369 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
366 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
369 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  23.14 
 
 
374 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  23.67 
 
 
416 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  26.05 
 
 
399 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 
368 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 
367 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
400 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 
371 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  22.78 
 
 
397 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 
368 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 
400 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
369 aa  100  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
376 aa  100  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  23.51 
 
 
403 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  22.19 
 
 
425 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  25.81 
 
 
368 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  22.55 
 
 
412 aa  99  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  25 
 
 
368 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  22.22 
 
 
409 aa  98.2  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
403 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  22.49 
 
 
410 aa  97.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  22.49 
 
 
410 aa  97.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>