More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2247 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  99.47 
 
 		 375 aa  742    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 375 aa  744    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  74.87 
 
 		 379 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  61.83 
 
 		 378 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  61.29 
 
 		 378 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  61.83 
 
 		 378 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  60.8 
 
 		 375 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  63.3 
 
 		 384 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  61.33 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  56.33 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  54.81 
 
 		 381 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  54.99 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  50.67 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  51.2 
 
 		 375 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  50.54 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  53.83 
 
 		 385 aa  352  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  54.32 
 
 		 389 aa  352  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  44.12 
 
 		 383 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 390 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  42.7 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  41.44 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  41.62 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 		 357 aa  226  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  40.81 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  41.14 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  42.02 
 
 		 369 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  37.37 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  35.67 
 
 		 369 aa  169  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 476 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  24.44 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  28.44 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  28.44 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 806 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 806 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.29 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  25.81 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 806 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.24 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.24 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.24 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.24 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.24 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.24 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 805 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  31.33 
 
 		 374 aa  67  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  25.92 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.24 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 815 aa  66.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 804 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  28.05 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2748  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0267692  normal  0.0112002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.28 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 802 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  25.45 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.22 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  21.97 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  25.93 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  25.93 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  21.72 
 
 		 500 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  26.94 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  25.53 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 823 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  21.12 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 		 799 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>