134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2748 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2748  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 384 aa  776    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0267692  normal  0.0112002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2963  oxidoreductase, FAD-binding protein  78.38 
 
 		 379 aa  591  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.12032  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3660  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03111  putative oxidoreductase signal peptide protein  28.33 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4207  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.81852  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 496 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 500 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  25.47 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  23.92 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  26.73 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  22.26 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  22.22 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 379 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 442 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  21.55 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  24.19 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  22.42 
 
 		 471 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 376 aa  53.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  22.93 
 
 		 371 aa  52.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  22.93 
 
 		 371 aa  52.8  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  22.93 
 
 		 371 aa  52.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  28.5 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  21.1 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 375 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  20.8 
 
 		 460 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 375 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25 
 
 		 369 aa  49.7  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  20.49 
 
 		 816 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 		 389 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  23.43 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  24.93 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  22.93 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  27.71 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 819 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1701  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00120296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.32 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  22.69 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 835 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.94 
 
 		 857 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.09 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  25 
 
 		 378 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  24.07 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  21.6 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.1 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.22 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  22.65 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  25.62 
 
 		 447 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 		 385 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  22.65 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 835 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 447 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  20.43 
 
 		 816 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  22.53 
 
 		 372 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  24.66 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  23.01 
 
 		 815 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 363 aa  46.2  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  22.78 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  25.26 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2176  hypothetical protein  24.69 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.491905 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  26.61 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  21.15 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.32 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  22.16 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  21.41 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  21.03 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  26.32 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>