More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1706 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 
371 aa  771    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 
371 aa  771    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 
371 aa  771    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  68.11 
 
 
371 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  64.52 
 
 
372 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  64.52 
 
 
372 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  64.52 
 
 
372 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  63.71 
 
 
372 aa  504  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  63.98 
 
 
372 aa  504  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  63.71 
 
 
372 aa  502  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  63.71 
 
 
372 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  63.71 
 
 
372 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  63.44 
 
 
372 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  61.46 
 
 
372 aa  498  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  62.16 
 
 
372 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  62.16 
 
 
372 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  61.89 
 
 
372 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  61.62 
 
 
372 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  61.35 
 
 
372 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  50.54 
 
 
373 aa  388  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  34.84 
 
 
376 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  35.62 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  34.75 
 
 
381 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 
375 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  34.3 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  34.99 
 
 
391 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 
443 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  32.89 
 
 
428 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  32.45 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 
381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  34.11 
 
 
386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  31.94 
 
 
390 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  31.2 
 
 
389 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  30.96 
 
 
385 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  33.76 
 
 
391 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  32.66 
 
 
391 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  34.72 
 
 
391 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  32.47 
 
 
389 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  33.76 
 
 
391 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  34.09 
 
 
395 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  32.89 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  31.65 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  32.98 
 
 
379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  29.31 
 
 
390 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  32.8 
 
 
383 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  30.19 
 
 
394 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 
384 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
363 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  29.43 
 
 
380 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  30.14 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  27.95 
 
 
366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  28.8 
 
 
382 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  27.04 
 
 
394 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  27.85 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  29.39 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  28.76 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.25 
 
 
399 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 
372 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  26.49 
 
 
397 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 
395 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  25.25 
 
 
452 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  25.7 
 
 
396 aa  93.6  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
423 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 
392 aa  89.4  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  22.68 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  21.94 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.19 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  23.85 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  22.86 
 
 
615 aa  69.7  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  22.25 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  23.55 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3660  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  21.72 
 
 
446 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
364 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  23.64 
 
 
442 aa  63.2  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.5 
 
 
386 aa  63.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2865  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 
397 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>