More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0024 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  100 
 
 		 381 aa  779    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  65.68 
 
 		 376 aa  532  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  57.22 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  56.72 
 
 		 377 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  56.95 
 
 		 428 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  54.03 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  51.33 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  42.82 
 
 		 375 aa  298  9e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  42.52 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  42.52 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  42.26 
 
 		 381 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  43.39 
 
 		 381 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  41.95 
 
 		 379 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  42.36 
 
 		 378 aa  279  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  39.32 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 		 379 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  37.11 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  34.12 
 
 		 373 aa  218  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  35.62 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  35.62 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  35.62 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  34.9 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  36.81 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  36.55 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  36.55 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  36.55 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  36.55 
 
 		 372 aa  209  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  36.55 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  36.55 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  36.55 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  36.55 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  35.25 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  35.44 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  35.51 
 
 		 372 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  35.51 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  35.51 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  36.04 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  35.51 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  32.12 
 
 		 385 aa  199  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  35.32 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  33.42 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  32.91 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  32.82 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  33.51 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  35.34 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  31.47 
 
 		 386 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  30.69 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  32.98 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  33.61 
 
 		 380 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  28.35 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  33.42 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  31.08 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  33.53 
 
 		 352 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.07 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  27.5 
 
 		 452 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  30.69 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 372 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  31.22 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  30.87 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  28.31 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  25.56 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  23.41 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  25.23 
 
 		 478 aa  93.6  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  27.3 
 
 		 396 aa  92.8  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 355 aa  92.8  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 367 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 500 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 496 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  26.75 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.08 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>