45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2963 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2963  oxidoreductase, FAD-binding protein  100 
 
 		 379 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.12032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2748  FAD dependent oxidoreductase  78.38 
 
 		 384 aa  591  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0267692  normal  0.0112002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3660  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03111  putative oxidoreductase signal peptide protein  28.2 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4207  FAD dependent oxidoreductase  55.38 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.81852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  27.84 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 496 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  21.7 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 500 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 500 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 375 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 375 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  25.75 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 		 471 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  21.57 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.32 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 363 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  24.15 
 
 		 363 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  26.37 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  26.37 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  26.37 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 375 aa  46.2  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  22.19 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  22.68 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 492 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>