More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03111 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03111  putative oxidoreductase signal peptide protein  100 
 
 		 378 aa  745    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3660  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2748  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0267692  normal  0.0112002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2963  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.73 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.12032  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  25.82 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  25.82 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  25.82 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  26.5 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  26.5 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4207  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.81852  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  28.35 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  26.95 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  25.68 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  29.17 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 815 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.78 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.37 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  30.47 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  26.27 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  30.32 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  28.28 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  27.87 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  25.9 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  26.51 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  23.68 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  27.88 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  22.28 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  41.3 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  25.9 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  25.9 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01760  conserved hypothetical protein  24.53 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 496 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  26.94 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 433 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 424 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  25.62 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  34.1 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 496 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 983 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  25.07 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  27.88 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 492 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  33.64 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  33.64 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  33.64 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>