214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0123 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 
373 aa  768    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  50.94 
 
 
372 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  50.94 
 
 
372 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  50.81 
 
 
372 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  50.94 
 
 
372 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  50.81 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  50.81 
 
 
372 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  50.81 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  50.94 
 
 
372 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  50.94 
 
 
372 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  50.67 
 
 
372 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  50.94 
 
 
372 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  50.81 
 
 
372 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  50.94 
 
 
372 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  50.67 
 
 
372 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  50.54 
 
 
371 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  50.54 
 
 
371 aa  388  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  51.21 
 
 
371 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  50.54 
 
 
371 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  49.33 
 
 
372 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  34.04 
 
 
389 aa  232  9e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  35.36 
 
 
381 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  34.12 
 
 
381 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  33.86 
 
 
376 aa  209  9e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  32.53 
 
 
378 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  33.06 
 
 
381 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  33.06 
 
 
381 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  31.87 
 
 
390 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  32.32 
 
 
391 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  32.98 
 
 
391 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  33.89 
 
 
375 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  33.51 
 
 
443 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  31.56 
 
 
381 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 
379 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 
428 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  32.36 
 
 
377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 
376 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  31.69 
 
 
386 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  31.54 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  29.79 
 
 
385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  31.54 
 
 
391 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  30.63 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  32.21 
 
 
379 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  32.23 
 
 
391 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  31.51 
 
 
395 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  29.85 
 
 
390 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
379 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  29.22 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  27.44 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  27.73 
 
 
380 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  28.76 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  29.53 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  26.84 
 
 
392 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 
372 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.92 
 
 
399 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 
355 aa  99.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  26.92 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  23.91 
 
 
452 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 
367 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  23.66 
 
 
394 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  23.32 
 
 
367 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  25.07 
 
 
389 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  24.86 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  22.92 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  23.08 
 
 
615 aa  76.3  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  24.81 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  21.67 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 
799 aa  68.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  24.1 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  21.3 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  21.58 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  22.84 
 
 
478 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53135  predicted protein  22.45 
 
 
432 aa  63.5  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0768437  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  21.49 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3660  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
352 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  22.56 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  22.9 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 
823 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  21.91 
 
 
378 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 
386 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  21.67 
 
 
383 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 
500 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>