246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1892 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 		 371 aa  770    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  68.11 
 
 		 371 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  68.11 
 
 		 371 aa  548  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  68.11 
 
 		 371 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  63.34 
 
 		 372 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  63.34 
 
 		 372 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  63.34 
 
 		 372 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  63.34 
 
 		 372 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  63.07 
 
 		 372 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  63.07 
 
 		 372 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  63.07 
 
 		 372 aa  513  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  62.8 
 
 		 372 aa  511  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  62.97 
 
 		 372 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  63.24 
 
 		 372 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  62.53 
 
 		 372 aa  510  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  62.7 
 
 		 372 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  62.97 
 
 		 372 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  62.16 
 
 		 372 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  61.08 
 
 		 372 aa  497  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  51.21 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  34.48 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  36.6 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  35.83 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  36.41 
 
 		 375 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  35.77 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  34.9 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  32.89 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  32.89 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  32.62 
 
 		 381 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  32.98 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 443 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  34.48 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  32.72 
 
 		 428 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  33.42 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  33.42 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  33.42 
 
 		 391 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  33.68 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  31.43 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  31.55 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  31.99 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  30.47 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 379 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  32.65 
 
 		 390 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  31.36 
 
 		 386 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  29.95 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  32.56 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  32 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  32.63 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  28.3 
 
 		 394 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  28.5 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  29.34 
 
 		 380 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  27.48 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  28.2 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  29.48 
 
 		 352 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  27.16 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  28.61 
 
 		 392 aa  109  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  27.92 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.95 
 
 		 399 aa  109  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  28.35 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  26.42 
 
 		 397 aa  106  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 395 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 372 aa  92.8  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  22.28 
 
 		 402 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  25.65 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  22.06 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  25.14 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  23.86 
 
 		 615 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  23.34 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  21.94 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  24.41 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  23.52 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  23.09 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.18 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  21.33 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  24.72 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  22.77 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  22.77 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  22.28 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  22.77 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>