286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1257 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  84.37 
 
 		 372 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  84.37 
 
 		 372 aa  660    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  84.1 
 
 		 372 aa  658    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  84.37 
 
 		 372 aa  660    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  84.1 
 
 		 372 aa  659    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  99.19 
 
 		 372 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  83.56 
 
 		 372 aa  655    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  83.83 
 
 		 372 aa  656    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  84.1 
 
 		 372 aa  659    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  99.73 
 
 		 372 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  98.12 
 
 		 372 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 		 372 aa  772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  83.83 
 
 		 372 aa  657    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  99.19 
 
 		 372 aa  765    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  76.22 
 
 		 372 aa  603  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  62.97 
 
 		 371 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  62.16 
 
 		 371 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  62.16 
 
 		 371 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  62.16 
 
 		 371 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  50.81 
 
 		 373 aa  399  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  35.1 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  33.78 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  34.54 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  34.54 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  35.01 
 
 		 376 aa  209  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  34.81 
 
 		 391 aa  206  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  35.51 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  34.31 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  32.65 
 
 		 386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  30.67 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  31.22 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  33.24 
 
 		 379 aa  192  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  34.3 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  33.84 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  32.98 
 
 		 443 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  34.51 
 
 		 391 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  32.8 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 379 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  32.05 
 
 		 391 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  31.35 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  31.17 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  30.03 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  29.67 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  28.24 
 
 		 390 aa  159  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  28.75 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  31.65 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  27.76 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  29.97 
 
 		 382 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  30.18 
 
 		 376 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  29.31 
 
 		 352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  26.42 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 374 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  28.61 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  24.49 
 
 		 394 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  27.03 
 
 		 392 aa  105  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  26.58 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  25.52 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  27.32 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 395 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.35 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  26.65 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 398 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06690  expressed protein  24.56 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.244503  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  23.96 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  21.98 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.92 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  24.12 
 
 		 615 aa  73.2  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00040  expressed protein  23.29 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  22.14 
 
 		 983 aa  63.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  21.85 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 984 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>