More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3660 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3660  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
352 aa  714    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03111  putative oxidoreductase signal peptide protein  40.62 
 
 
378 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155169  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2748  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
384 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0267692  normal  0.0112002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2963  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.73 
 
 
379 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.12032  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
378 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  25.07 
 
 
371 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  25.07 
 
 
371 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  25.07 
 
 
371 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  27.01 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  24.52 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  25.57 
 
 
371 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 
823 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  22.6 
 
 
385 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  27.98 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  26.27 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  26.11 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
476 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  28.45 
 
 
511 aa  63.5  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  26.92 
 
 
476 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4207  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
359 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.81852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  22.54 
 
 
385 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  24.65 
 
 
381 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  24.65 
 
 
381 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 
387 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2155  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)-like protein  27.91 
 
 
604 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.195632  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1170  hypothetical protein  25.9 
 
 
631 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 
825 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  25.57 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.07 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
806 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 
375 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  21.75 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  26.73 
 
 
391 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  24.5 
 
 
372 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 
806 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 
394 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  26.34 
 
 
822 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
799 aa  60.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 
494 aa  60.1  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 
485 aa  59.7  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  25.57 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  30.7 
 
 
392 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
826 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.23 
 
 
838 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  27.88 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  24.08 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 
394 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 
835 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 
375 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  26.52 
 
 
410 aa  57  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  24.17 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  22.26 
 
 
371 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
364 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  26.52 
 
 
410 aa  56.6  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  26.09 
 
 
389 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  25 
 
 
428 aa  56.2  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  21.71 
 
 
371 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
835 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  21.95 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  24.77 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  23.93 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  23.93 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 
479 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  28.95 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 
375 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  25 
 
 
443 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 
388 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  23.43 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 
960 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  23.93 
 
 
372 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
375 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  23.93 
 
 
372 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
375 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  21.65 
 
 
371 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 
374 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  21.65 
 
 
371 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  21.65 
 
 
371 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  26.98 
 
 
367 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  28.44 
 
 
390 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  24.31 
 
 
402 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  24.71 
 
 
378 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 
382 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  27.57 
 
 
378 aa  53.5  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  23.65 
 
 
372 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  23.65 
 
 
372 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  23.65 
 
 
372 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
393 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>