227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2708 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  100 
 
 		 391 aa  792    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  54.45 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  53.68 
 
 		 390 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  49.35 
 
 		 385 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  49.36 
 
 		 386 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  50.78 
 
 		 391 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  52.22 
 
 		 391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  47.52 
 
 		 391 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  48.3 
 
 		 391 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  42.05 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  43.15 
 
 		 381 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  40.98 
 
 		 443 aa  262  8.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  41.15 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  40.05 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  40.05 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  40.9 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  39.8 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  40.48 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  40.11 
 
 		 375 aa  242  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  39.11 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  35.99 
 
 		 379 aa  232  8.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  38.32 
 
 		 376 aa  229  7e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  37.6 
 
 		 377 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  34.9 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  34.92 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  36.99 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  35.58 
 
 		 372 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  35.32 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  35.32 
 
 		 372 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  35.32 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  35.32 
 
 		 372 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  35.06 
 
 		 372 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  34.81 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  34.81 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  34.81 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  34.81 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  34.55 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  34.81 
 
 		 372 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  34.81 
 
 		 372 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  35.77 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  34.81 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  34.99 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  34.99 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  34.99 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  32.98 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  34.37 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  35.79 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 379 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  32.91 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  31.77 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  33.05 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  32.75 
 
 		 392 aa  123  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 355 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  29.11 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  27.68 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  32.04 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.63 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  30.35 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  28.01 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 422 aa  106  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 402 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  23.97 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 391 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  26.7 
 
 		 478 aa  97.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  28.09 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  26.67 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  25.73 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  27.25 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  23.91 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2901  sarcosine oxidase  25.97 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  24.63 
 
 		 615 aa  77.4  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2865  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 400 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2605  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  28.26 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.62 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  25.37 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.656567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>