108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1492 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 398 aa  827    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  67.01 
 
 		 398 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  24.32 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 379 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  27.39 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  27.75 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  23.96 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  25.71 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  25.71 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  26.55 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  26.55 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  24.42 
 
 		 381 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  24.74 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  25.45 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  25.45 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  25.96 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  25.52 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  25.13 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  25.72 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  26.03 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  25.06 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  25.06 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  25.06 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  25.06 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  25.06 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  25.06 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  25.06 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  25.06 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  24.81 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  25 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  25.19 
 
 		 443 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  25.52 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  24.23 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  24.73 
 
 		 394 aa  89.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  23.39 
 
 		 371 aa  89.7  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  23.06 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  24.37 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  24.88 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  23.06 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  22.68 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  22.68 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  22.68 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  23.85 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  22.65 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  24.74 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  22.36 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  24.07 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  22.59 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  23.69 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  23.48 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  23.65 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  22.34 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  23.79 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  25.62 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  24.45 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  23.31 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  24.59 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  21.38 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  19.33 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  22.25 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  22.42 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  21.32 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  21.67 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  21.08 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  22.68 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03870  conserved hypothetical protein  37.31 
 
 		 318 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.370608  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  24.93 
 
 		 382 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 424 aa  49.7  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  21.89 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  20.18 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  23.18 
 
 		 452 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 		 424 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  21.5 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  21.96 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  20.63 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  22.43 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3259  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  26.57 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0253347  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  25.11 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  21.96 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  31.18 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 799 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  22.92 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1108  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  25.87 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34769  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  21.79 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  21.43 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  19.73 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>