131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3775 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  100 
 
 		 382 aa  776    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  33.96 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  33.6 
 
 		 375 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  32.31 
 
 		 379 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  32.1 
 
 		 378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  31.94 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  31.94 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  30.15 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  31.41 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  30.63 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  31.74 
 
 		 390 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  32.15 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  32.7 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  33 
 
 		 389 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  30.87 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  30.85 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  33.59 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  32.31 
 
 		 443 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  32.31 
 
 		 428 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  28.75 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  33.68 
 
 		 391 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  28.13 
 
 		 373 aa  144  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  31.23 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  31.09 
 
 		 391 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  30.96 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  30.03 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  31.66 
 
 		 391 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  29.77 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  30.03 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  29.77 
 
 		 372 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  29.5 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  29.4 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  29.4 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  29.4 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  30.13 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  29.53 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  28.42 
 
 		 372 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  27.78 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  28.53 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  28.53 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 379 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  28.8 
 
 		 372 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  28.8 
 
 		 372 aa  123  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  28.8 
 
 		 372 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  28.53 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  28.53 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  28.53 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  28.53 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  30.56 
 
 		 389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  31.09 
 
 		 383 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.63 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  30.33 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  30.11 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  25.52 
 
 		 452 aa  99.8  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  27.89 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  25.26 
 
 		 394 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 		 478 aa  89.7  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 384 aa  86.3  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  27.87 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  29.17 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  26.07 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  24.6 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  25.45 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  24.74 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  27.37 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06690  expressed protein  28.91 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.244503  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53135  predicted protein  24.23 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0768437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  32.48 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  23.37 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.656567 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  22.47 
 
 		 615 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  22.62 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  22.62 
 
 		 378 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 390 aa  54.3  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 375 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  26.27 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>