70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47550 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  100 
 
 		 452 aa  941    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  29.55 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  29.12 
 
 		 377 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  28.8 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  28.8 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  30.39 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  30.39 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  29.57 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  27.05 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  30.48 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  29.79 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  28.17 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  28.38 
 
 		 381 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  27.06 
 
 		 379 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  27.29 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  27.29 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  27.69 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  26.83 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  28.57 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  27.09 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  28.95 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  25.62 
 
 		 391 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  27.55 
 
 		 386 aa  113  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  28.24 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  28.37 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  28.94 
 
 		 379 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  26.52 
 
 		 372 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  26.53 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  26.47 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  26.24 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  26.24 
 
 		 372 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  26.47 
 
 		 372 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  25.52 
 
 		 382 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  24.94 
 
 		 371 aa  99  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  24.94 
 
 		 371 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  24.94 
 
 		 371 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  26.04 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  23.95 
 
 		 373 aa  97.8  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  25.56 
 
 		 392 aa  90.1  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.09 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  25.45 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  25.4 
 
 		 372 aa  86.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  25.4 
 
 		 372 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  25.4 
 
 		 372 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  25.4 
 
 		 372 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  25.17 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  27.92 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  25.4 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  25.17 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  25.17 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  25.88 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  25.17 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  24.69 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  22.9 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  27.21 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  24.69 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  25.38 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  22.68 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  22.11 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  22.93 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  23.14 
 
 		 367 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00040  expressed protein  25.78 
 
 		 520 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2865  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  22.89 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  38.16 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>