159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53135 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_53135  predicted protein  100 
 
 
432 aa  894    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0768437  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08982  hypothetical fructosyl amine:oxygen oxidoreductase (Eurofung)  38.16 
 
 
438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00220  fructosyl amino acid oxidase, putative  35.56 
 
 
477 aa  231  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.113312  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08123  Fructosyl amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UT4]  33.1 
 
 
438 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0895572 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05930  Peroxisomal sarcosine oxidase, putative  33.25 
 
 
448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  31.45 
 
 
615 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  28.97 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  29.26 
 
 
441 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 
456 aa  152  8.999999999999999e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03870  conserved hypothetical protein  27.88 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.370608  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06647  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 
440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06690  expressed protein  25.98 
 
 
504 aa  113  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.244503  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00040  expressed protein  23.59 
 
 
520 aa  99  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  23.38 
 
 
478 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 
402 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 
363 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  21.49 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  22.42 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  21.73 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  21.73 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  23.58 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  20.74 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10768  conserved hypothetical protein  32.76 
 
 
255 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0104638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  22.96 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  23.24 
 
 
375 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  23.34 
 
 
422 aa  63.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  22.45 
 
 
373 aa  63.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  20.84 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.22 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  23.17 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  24.55 
 
 
391 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 
385 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
379 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  22.31 
 
 
385 aa  60.1  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  23.53 
 
 
390 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  24.23 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  23.58 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  22.49 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  20.41 
 
 
391 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  20.97 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  22.46 
 
 
372 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  23.12 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 
440 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  23.12 
 
 
443 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  21.84 
 
 
372 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  21.84 
 
 
372 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  21.58 
 
 
372 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  21.58 
 
 
372 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  23.36 
 
 
428 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  21.84 
 
 
372 aa  57.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  21.58 
 
 
372 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  24.11 
 
 
372 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  21.84 
 
 
372 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.15 
 
 
415 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  21.58 
 
 
372 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 
442 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  23.84 
 
 
380 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  31.25 
 
 
389 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  22.02 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  25.58 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  22.09 
 
 
398 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 
385 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  22.56 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  20.43 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  20.89 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  20.93 
 
 
386 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  22.51 
 
 
416 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 
446 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  23.44 
 
 
376 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 
385 aa  53.5  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  34.78 
 
 
383 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
835 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  20.71 
 
 
384 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  22.73 
 
 
423 aa  53.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  26.03 
 
 
819 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  20.88 
 
 
390 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  34.43 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
385 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  21.21 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  20.88 
 
 
390 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.15 
 
 
830 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  23.79 
 
 
391 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  21.21 
 
 
390 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  23.63 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 
445 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 
392 aa  50.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  22.54 
 
 
394 aa  50.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  23.19 
 
 
382 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  21.16 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.86 
 
 
821 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  21.68 
 
 
372 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.75 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
428 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  23.83 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.7 
 
 
838 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  21.41 
 
 
372 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  21.41 
 
 
372 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.431985 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>