182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8831 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
402 aa  795    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
363 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 
422 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  30.71 
 
 
378 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  30.85 
 
 
381 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  31.71 
 
 
390 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  27.59 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  27.59 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  26.92 
 
 
385 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  28.68 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  31.43 
 
 
380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  26.58 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  26.61 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  29.31 
 
 
379 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  25.27 
 
 
367 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
367 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  26.92 
 
 
391 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  27.99 
 
 
391 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  25.9 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  26.8 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  30.11 
 
 
352 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  27.34 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  30.65 
 
 
383 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  29.5 
 
 
377 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  30.98 
 
 
391 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  26.4 
 
 
394 aa  96.3  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  26.13 
 
 
391 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  26.28 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  26.28 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  28.07 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  24.22 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  24.22 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  24.22 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  25.48 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  25.69 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  29.65 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
372 aa  90.5  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  22.28 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  25.45 
 
 
389 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  23.86 
 
 
478 aa  87  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53135  predicted protein  23.35 
 
 
432 aa  87  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0768437  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
384 aa  86.3  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  26.41 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  25.9 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  21.97 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  21.97 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  21.97 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  22.86 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  21.72 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  21.98 
 
 
372 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  21.98 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  21.98 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  25.5 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  21.46 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  21.46 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  22.22 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  21.98 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  21.46 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  21.21 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  25.47 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  21.17 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  23.4 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  24.94 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  22.14 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  27.06 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.51 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  22.54 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  22.92 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  27.32 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  25.3 
 
 
452 aa  66.2  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
355 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  23.67 
 
 
400 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  21.55 
 
 
615 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06690  expressed protein  21.19 
 
 
504 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.244503  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  23.99 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
398 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
398 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08982  hypothetical fructosyl amine:oxygen oxidoreductase (Eurofung)  22.33 
 
 
438 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 
401 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  26.77 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
375 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  26.77 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  26.77 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  26.77 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
375 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
374 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00040  expressed protein  19.57 
 
 
520 aa  57.4  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
375 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  27.17 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  26.42 
 
 
392 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.97 
 
 
386 aa  56.6  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  26.72 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>