291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0252 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  100 
 
 		 397 aa  816    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  83.93 
 
 		 396 aa  671    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  52.99 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  29.79 
 
 		 378 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 398 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  27.2 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  28.72 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  30.18 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  28.32 
 
 		 391 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 379 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  29.21 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  26.49 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  26.49 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  26.49 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  25.78 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  25.78 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  27.59 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  29.4 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  29.4 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  29.4 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  25.26 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  30.77 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  25.26 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  29.95 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  29.11 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  29.5 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  25.52 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  27.41 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  26.87 
 
 		 372 aa  103  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  28.57 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  27.2 
 
 		 394 aa  99.4  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  31.02 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  30.12 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  28.13 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  29.08 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  26.67 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  27.89 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  30.21 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.34 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  26.3 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  25.58 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  25.58 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  25.58 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  27.13 
 
 		 381 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  25.58 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  25.58 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  25.84 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  25.32 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  25.58 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  28.61 
 
 		 443 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  25.77 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  28.24 
 
 		 428 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  28.61 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  28.49 
 
 		 383 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  30.57 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  24.73 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  24.8 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  25.32 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  26.58 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  24.5 
 
 		 615 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  24.75 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  28.28 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  27.32 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  22.28 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  25.54 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 799 aa  66.6  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 853 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 815 aa  63.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 		 816 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53135  predicted protein  23.12 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0768437  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  47.5 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 853 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.19 
 
 		 857 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 815 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  26.56 
 
 		 461 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 816 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  29.07 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>