197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4751 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  87.23 
 
 
377 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 
376 aa  757    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  63.73 
 
 
443 aa  471  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  63.9 
 
 
428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  56.65 
 
 
376 aa  413  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  54.03 
 
 
381 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  46.93 
 
 
379 aa  335  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  47.73 
 
 
381 aa  319  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  47.59 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  46.38 
 
 
375 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  45.36 
 
 
381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  45.36 
 
 
381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  45.36 
 
 
381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  44.85 
 
 
378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  39.11 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  37.77 
 
 
389 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  40.25 
 
 
389 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  35.38 
 
 
385 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  40.37 
 
 
390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  39.8 
 
 
391 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  35.83 
 
 
371 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  39.42 
 
 
383 aa  205  8e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  37.76 
 
 
390 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  34.3 
 
 
371 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  34.3 
 
 
371 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  34.3 
 
 
371 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  36.02 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  35.2 
 
 
391 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  34.72 
 
 
386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  37.59 
 
 
395 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  34.17 
 
 
391 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  34.39 
 
 
372 aa  193  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  33.96 
 
 
372 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  33.96 
 
 
372 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  33.96 
 
 
372 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  33.86 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  34.13 
 
 
372 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  34.13 
 
 
372 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  34.13 
 
 
372 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  33.86 
 
 
372 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  34.3 
 
 
372 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  34.92 
 
 
372 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 
373 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  34.3 
 
 
372 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  34.04 
 
 
372 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  33.77 
 
 
372 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  33.77 
 
 
372 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  34.72 
 
 
391 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  33.91 
 
 
392 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  36.41 
 
 
399 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  34.25 
 
 
380 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  32.15 
 
 
382 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  35.01 
 
 
389 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  35.11 
 
 
376 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  35.63 
 
 
352 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
363 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  29.78 
 
 
452 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  32.68 
 
 
366 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
374 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  29.31 
 
 
396 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
422 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
372 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 
367 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  26.32 
 
 
367 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 
402 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  29.08 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  23.27 
 
 
394 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  25.78 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  26.9 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.656567 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
385 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  25.99 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  25.19 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
446 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 
394 aa  63.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  23.93 
 
 
394 aa  63.5  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 
983 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
984 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
378 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  26.43 
 
 
446 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
364 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
394 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>