117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4607 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 364 aa  720    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  30.23 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  27.35 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  34.56 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  26.29 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  27.35 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  30.09 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  30.09 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.14 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  26.63 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  26.84 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  26.84 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  26.84 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  28.01 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  27.64 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  27.65 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  28.96 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  29.13 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  25.29 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  30.88 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  27.73 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  29.68 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  31.55 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  31.55 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  26.08 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 441 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  26.08 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  24.12 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  25.54 
 
 		 372 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  25 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  26.59 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  25.74 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  27.85 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  22.9 
 
 		 385 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  31.71 
 
 		 460 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  25.74 
 
 		 372 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  25.74 
 
 		 372 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  25.74 
 
 		 372 aa  49.7  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  25.74 
 
 		 372 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 402 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 500 aa  49.7  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  25.53 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  25.53 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  26.82 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  25.3 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  25.53 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  25.58 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  28.21 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  25.47 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  25.43 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  23.64 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  30.77 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 446 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  28 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  26.05 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  40.79 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  40.79 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  27.06 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 493 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  26.54 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  37.36 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  61.76 
 
 		 609 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  39.44 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 835 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  25.22 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 423 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 423 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  35.37 
 
 		 428 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  26.56 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 500 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 500 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2557  dehydrogenase (flavoproteins)  28.57 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 960 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  27.78 
 
 		 442 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 471 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>