243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0768 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  91.42 
 
 		 443 aa  769    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 		 428 aa  868    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  64 
 
 		 376 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  62.93 
 
 		 377 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  57.14 
 
 		 381 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  57.98 
 
 		 376 aa  433  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  45.99 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  47 
 
 		 381 aa  312  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  47.61 
 
 		 375 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  45.91 
 
 		 379 aa  289  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  43.54 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  43.54 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  42.78 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  42.15 
 
 		 378 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  40.9 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  41.15 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  37.56 
 
 		 385 aa  235  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  37.24 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  36.39 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  36.1 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  38.66 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  36.83 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  35.22 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  35.66 
 
 		 391 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  36.48 
 
 		 395 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 371 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 371 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 371 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  33.42 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  32.9 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  35.86 
 
 		 390 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  35.37 
 
 		 391 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  33.6 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  33.6 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  32.89 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  33.6 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  33.33 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  33.33 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  32.89 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  33.33 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  33.33 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  32.89 
 
 		 372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  32.89 
 
 		 372 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  32.8 
 
 		 372 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  34.02 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 372 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  34.04 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  33.07 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  32.88 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  32.41 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  30.94 
 
 		 392 aa  131  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  28.86 
 
 		 452 aa  130  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  32.25 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  32.66 
 
 		 352 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  29.3 
 
 		 366 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  30.47 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 402 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  27.59 
 
 		 367 aa  93.2  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  27.18 
 
 		 396 aa  88.2  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  25.87 
 
 		 394 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 374 aa  86.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  27.69 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  25.76 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.656567 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  24.09 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  25.29 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  25.42 
 
 		 615 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 984 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 983 aa  73.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 391 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 394 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.62 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>