More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1323 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  100 
 
 
376 aa  766    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  65.68 
 
 
381 aa  532  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  58.29 
 
 
443 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  58.02 
 
 
428 aa  431  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  57.98 
 
 
377 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  56.65 
 
 
376 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  55.97 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  43.77 
 
 
381 aa  286  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  43.43 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  43.68 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  41.95 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  43.42 
 
 
381 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  43.42 
 
 
381 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  41.73 
 
 
379 aa  265  8.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  40.91 
 
 
378 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 
379 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  38.32 
 
 
391 aa  229  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  37.69 
 
 
390 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  34.84 
 
 
371 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  34.84 
 
 
371 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  35.06 
 
 
385 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  34.84 
 
 
371 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  35.28 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  35.28 
 
 
372 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  35.28 
 
 
372 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  36.02 
 
 
389 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  35.01 
 
 
372 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  35.01 
 
 
372 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  33.86 
 
 
373 aa  209  9e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  37.08 
 
 
390 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  34.48 
 
 
371 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  34.38 
 
 
372 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  33.86 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  33.86 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  33.86 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  33.6 
 
 
372 aa  199  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  33.6 
 
 
372 aa  199  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  33.77 
 
 
372 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  33.77 
 
 
372 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  33.6 
 
 
372 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  33.77 
 
 
372 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  33.85 
 
 
391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  33.25 
 
 
391 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  33.42 
 
 
386 aa  196  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  32.91 
 
 
391 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  34.95 
 
 
394 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  33.76 
 
 
395 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  34.86 
 
 
391 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  35.45 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
384 aa  175  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  36.24 
 
 
380 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  29.84 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  35.19 
 
 
376 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  30.25 
 
 
452 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  35.05 
 
 
399 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  33.43 
 
 
352 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  32.3 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
363 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  30.17 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  31.84 
 
 
389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  29.21 
 
 
397 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
367 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
374 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  24.37 
 
 
394 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
422 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  26.69 
 
 
367 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  28.39 
 
 
396 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
355 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
398 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
392 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  27.98 
 
 
428 aa  87.4  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  25.44 
 
 
615 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  26 
 
 
478 aa  76.3  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
500 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
492 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  25.19 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
496 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>