125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6672 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 398 aa  822    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  67.01 
 
 		 398 aa  558  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  26.02 
 
 		 394 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  27.04 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  29.97 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  29.46 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  29.46 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  28.06 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  25.19 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  30.26 
 
 		 378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  28.94 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  27.92 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  27.16 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  25.78 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  27.05 
 
 		 443 aa  103  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  26.9 
 
 		 428 aa  103  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  29.14 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  25.32 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  28.17 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  27.05 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  26.73 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  24.56 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  27.2 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  25.63 
 
 		 372 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  25.63 
 
 		 372 aa  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  25.66 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  25.38 
 
 		 372 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  24.55 
 
 		 372 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  25.38 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  25.06 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  24.49 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  24.55 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  24.55 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  24.48 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  24.48 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  24.48 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  24.48 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  24.55 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  25.32 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  24.55 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  24.87 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  24.87 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  24.87 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  24.03 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  26.32 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  27.11 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  23.63 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  25.69 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  25.12 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  23.02 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  24.19 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  29.67 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  23.34 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  24.87 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  27.83 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  24.18 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  23.55 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  24.26 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  22.84 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  22.96 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  21.72 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.01 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  23.14 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  24.6 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  21.59 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  24.03 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  22.17 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1608  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.11 
 
 		 554 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.364295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  22.68 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94246  predicted protein  23.89 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0800134  normal  0.0557343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  21.96 
 
 		 815 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  26.43 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  24.79 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  24.79 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 375 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  21.52 
 
 		 799 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  24.32 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 492 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  22.46 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  21.2 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4919  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  26.26 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0956647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  22.14 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>