12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_94246 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_94246  predicted protein  100 
 
 
410 aa  828    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0800134  normal  0.0557343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
391 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2901  sarcosine oxidase  26.16 
 
 
397 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2605  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803313  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2865  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2102  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
395 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  24.88 
 
 
391 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 
398 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  26.24 
 
 
381 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  24.05 
 
 
375 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  23.36 
 
 
376 aa  43.1  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>