44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2901 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2901  sarcosine oxidase  100 
 
 		 397 aa  805    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  57.8 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  56.78 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2605  FAD dependent oxidoreductase  49.36 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2865  FAD dependent oxidoreductase  49.36 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2102  FAD dependent oxidoreductase  52.66 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  28.21 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94246  predicted protein  26.16 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0800134  normal  0.0557343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  25.65 
 
 		 386 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  29.25 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  25.97 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  26.07 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  26.09 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  30.29 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  26.8 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  28.04 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  25.63 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  26.36 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  27.27 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  26.68 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  27.02 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  25.96 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  25.96 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  28.05 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  26.45 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  29.28 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  27.14 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  28.91 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  22.8 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  22.75 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  22.74 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  21.07 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  22.63 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 376 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  22.37 
 
 		 372 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  22.37 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  22.11 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  24.06 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.27 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>