More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0991 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
432 aa  881    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0863  FAD dependent oxidoreductase  91.39 
 
 
430 aa  762    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  52.99 
 
 
411 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3794  FAD dependent oxidoreductase  52.22 
 
 
411 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 
401 aa  256  7e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  38.62 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  36.6 
 
 
401 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
409 aa  236  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 
402 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 
401 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05617  FAD dependent oxidoreductase, putative  35.91 
 
 
417 aa  215  9e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 
402 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1232  hypothetical protein  30.48 
 
 
397 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1332  hypothetical protein  30.48 
 
 
397 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1407  hypothetical protein  30.23 
 
 
397 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1209  oxidoreductase  30.15 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3187  oxidoreductase, putative  30.37 
 
 
405 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.70562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1233  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 
397 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3172  oxidoreductase  30.37 
 
 
405 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3195  oxidoreductase  30.1 
 
 
405 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4319  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 
399 aa  192  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1211  oxidoreductase  29.78 
 
 
397 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3974  hypothetical protein  30.02 
 
 
397 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1431  hypothetical protein  29.78 
 
 
397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1370  hypothetical protein  30.2 
 
 
398 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1472  hypothetical protein  29.03 
 
 
397 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
428 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
514 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 
434 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  25.13 
 
 
508 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  29.47 
 
 
430 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  29.47 
 
 
430 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  29.47 
 
 
430 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  24.06 
 
 
508 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 
508 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.63 
 
 
479 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  24.09 
 
 
508 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  24.09 
 
 
508 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  23.5 
 
 
508 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  23.5 
 
 
508 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  24.56 
 
 
508 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 
506 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  24.56 
 
 
508 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  23.81 
 
 
508 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
423 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 
510 aa  101  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
421 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  27.57 
 
 
430 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1063  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
437 aa  99.8  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
433 aa  99.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  27.46 
 
 
439 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
434 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
430 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  26.02 
 
 
437 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
437 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  26.75 
 
 
438 aa  98.2  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
435 aa  97.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 
433 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
453 aa  97.1  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  26.33 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  24.81 
 
 
435 aa  95.9  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  21.66 
 
 
508 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  27.82 
 
 
468 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
429 aa  94  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  28.32 
 
 
468 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
437 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  27.82 
 
 
468 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
433 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
430 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 
426 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 
425 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
424 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 
435 aa  92.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
474 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  25.06 
 
 
463 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
436 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
431 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
508 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  26.67 
 
 
454 aa  89.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  24.31 
 
 
428 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 
435 aa  89.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 
435 aa  89.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  25.58 
 
 
463 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
463 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
427 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  26.14 
 
 
427 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 
526 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
531 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  23.08 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 
482 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
430 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
428 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  24.87 
 
 
430 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
430 aa  87  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 
428 aa  87  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 
428 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 
428 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>