More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5894 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 506 aa  1035    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  58.27 
 
 		 510 aa  610  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  47.57 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  41.63 
 
 		 526 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 510 aa  273  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 521 aa  269  8e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  34.37 
 
 		 524 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  32.26 
 
 		 508 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 508 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  32.06 
 
 		 508 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  32.06 
 
 		 508 aa  266  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  32.06 
 
 		 508 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.59 
 
 		 508 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.59 
 
 		 508 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  31.79 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 		 513 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 604 aa  259  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 508 aa  259  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  31.53 
 
 		 508 aa  259  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  31.67 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  33.27 
 
 		 521 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 513 aa  257  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 531 aa  257  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  32.8 
 
 		 525 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  32.93 
 
 		 525 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 508 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 507 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 513 aa  243  5e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  32.67 
 
 		 507 aa  237  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 592 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.3 
 
 		 479 aa  226  9e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 		 499 aa  219  6e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  31.2 
 
 		 504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 		 506 aa  207  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 508 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 504 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 504 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 		 507 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.43 
 
 		 517 aa  189  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.66 
 
 		 227 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 503 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  29.56 
 
 		 394 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 502 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 518 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 499 aa  156  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 388 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10493  hypothetical protein  32.41 
 
 		 289 aa  120  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000931563  normal  0.209074 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 432 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 401 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 411 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3195  oxidoreductase  24.05 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3172  oxidoreductase  24.05 
 
 		 405 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3187  oxidoreductase, putative  24.3 
 
 		 405 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.70562  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3794  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 411 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 401 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  26.34 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0863  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05617  FAD dependent oxidoreductase, putative  25.58 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0367368  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  26.47 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1233  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0182  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0665  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.691496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  24.68 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1232  hypothetical protein  22.76 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1332  hypothetical protein  22.76 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  25.87 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3751  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4319  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  28.23 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1407  hypothetical protein  22.76 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  25.38 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  28.23 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  28.23 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  28.23 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  28.23 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 424 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>