More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0665 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2718  FAD dependent oxidoreductase  89.96 
 
 		 472 aa  862    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0586  FAD dependent oxidoreductase  94.32 
 
 		 473 aa  893    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53707  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3751  FAD dependent oxidoreductase  95.58 
 
 		 473 aa  906    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0665  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 475 aa  969    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.691496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0182  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 475 aa  969    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0560  FAD dependent oxidoreductase  94.32 
 
 		 473 aa  892    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0632  FAD dependent oxidoreductase  97.89 
 
 		 473 aa  920    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  35.95 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 		 430 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 429 aa  186  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.04 
 
 		 426 aa  183  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 426 aa  183  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.04 
 
 		 426 aa  183  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.04 
 
 		 426 aa  183  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.04 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.04 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.8 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.8 
 
 		 426 aa  180  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  34.43 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  31.17 
 
 		 449 aa  177  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 435 aa  176  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4020  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471109  normal  0.716709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3625  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 429 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 426 aa  173  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1813  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 429 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00738573  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 		 433 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 429 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 		 433 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 433 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  33.33 
 
 		 430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1847  FAD dependent oxidoreductase  34.37 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.948299  hitchhiker  0.00800428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  33.1 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  33.1 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 428 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  29.71 
 
 		 429 aa  163  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 428 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 428 aa  163  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 428 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  30.99 
 
 		 429 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  28.61 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  28.61 
 
 		 428 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  31.44 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  30.93 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 429 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  32.6 
 
 		 428 aa  160  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 429 aa  160  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  32.52 
 
 		 468 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  32.28 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  31.66 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  32.28 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  30.9 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 429 aa  156  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  32.03 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2421  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 430 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  29.52 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>