More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3537 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  100 
 
 		 427 aa  871    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  52.01 
 
 		 409 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  38.62 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3794  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0863  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  38.71 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 401 aa  232  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  36.6 
 
 		 402 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4319  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3172  oxidoreductase  29.62 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3195  oxidoreductase  29.68 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3187  oxidoreductase, putative  29.37 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.70562  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1211  oxidoreductase  27.59 
 
 		 397 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1232  hypothetical protein  27.09 
 
 		 397 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1332  hypothetical protein  27.09 
 
 		 397 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05617  FAD dependent oxidoreductase, putative  29.25 
 
 		 417 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0367368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1407  hypothetical protein  26.85 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1209  oxidoreductase  27.09 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3974  hypothetical protein  26.91 
 
 		 397 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1370  hypothetical protein  26.98 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1431  hypothetical protein  26.77 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1472  hypothetical protein  27.05 
 
 		 397 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1233  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 526 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  24.57 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.6 
 
 		 479 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 424 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 510 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 531 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 425 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  24.87 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 514 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 506 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  24.39 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 473 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  23.41 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  23.83 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  22.63 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  23.7 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  23.19 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  22.55 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  23.87 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  23.1 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  23.34 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  22.92 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  23.34 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  22.69 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  23.34 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  22.73 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  20.38 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  24.45 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  22.28 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  22.44 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  21.27 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  22.91 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  23.56 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>