More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0767 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 
479 aa  989    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  53.57 
 
 
482 aa  545  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 
520 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  42.68 
 
 
521 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  40.16 
 
 
513 aa  398  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  39.92 
 
 
508 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  41.9 
 
 
510 aa  388  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  38.9 
 
 
508 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  40.12 
 
 
508 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  40.12 
 
 
508 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  40.12 
 
 
508 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  39.31 
 
 
508 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  39.31 
 
 
508 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  39.31 
 
 
508 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  38.49 
 
 
508 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  39.1 
 
 
508 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 
508 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  38.9 
 
 
508 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  40.57 
 
 
521 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 
507 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 
513 aa  362  6e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 
435 aa  356  5e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  38.21 
 
 
525 aa  346  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  38.21 
 
 
525 aa  342  9e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 
524 aa  335  1e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 
604 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
516 aa  292  8e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 
592 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 
504 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 
508 aa  276  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 
531 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 
512 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
510 aa  249  9e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  36.39 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
514 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.07 
 
 
517 aa  241  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
506 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
526 aa  232  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  29.82 
 
 
504 aa  227  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 
499 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
506 aa  226  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
504 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
507 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
504 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
499 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
502 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  31.4 
 
 
507 aa  217  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
518 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 
501 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 
513 aa  203  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 
503 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
513 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
388 aa  149  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1211  oxidoreductase  27.92 
 
 
397 aa  124  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1472  hypothetical protein  27.41 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
227 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1209  oxidoreductase  26.9 
 
 
397 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3974  hypothetical protein  27.41 
 
 
397 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1233  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
397 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1431  hypothetical protein  26.65 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3172  oxidoreductase  28.95 
 
 
405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1232  hypothetical protein  26.4 
 
 
397 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1332  hypothetical protein  26.4 
 
 
397 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1370  hypothetical protein  27.09 
 
 
398 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3187  oxidoreductase, putative  28.42 
 
 
405 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.70562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1407  hypothetical protein  26.4 
 
 
397 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3195  oxidoreductase  28.42 
 
 
405 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 
432 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 
428 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  22.48 
 
 
444 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  22.48 
 
 
425 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 
444 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  24.6 
 
 
427 aa  93.6  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 
425 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 
444 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 
420 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  22.38 
 
 
442 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
401 aa  90.5  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 
402 aa  90.1  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 
429 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  25.58 
 
 
429 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
402 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  22.82 
 
 
438 aa  87  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 
424 aa  87  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  25.98 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  22.6 
 
 
445 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  23.78 
 
 
424 aa  84  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  21.27 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  22.46 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  22.58 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0863  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4319  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
399 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 
409 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  20.72 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  22.82 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  22.82 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>