More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2768 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
506 aa  992    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  62.75 
 
 
517 aa  580  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  57.85 
 
 
503 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  45.76 
 
 
502 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  48.29 
 
 
501 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  47.53 
 
 
504 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  47.53 
 
 
504 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  45.29 
 
 
518 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  47.45 
 
 
507 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  46.18 
 
 
499 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  39.05 
 
 
513 aa  286  9e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
520 aa  282  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 
524 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  32.63 
 
 
521 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
521 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
508 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  36.65 
 
 
604 aa  272  9e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
508 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  31.95 
 
 
508 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  32.43 
 
 
508 aa  264  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  32.22 
 
 
508 aa  263  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  31.7 
 
 
508 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.18 
 
 
508 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.18 
 
 
508 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 
510 aa  262  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.31 
 
 
508 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  31.31 
 
 
508 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 
508 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 
508 aa  259  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.51 
 
 
508 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
507 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 
513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.47 
 
 
525 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.47 
 
 
525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 
592 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 
512 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.49 
 
 
479 aa  238  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
516 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
531 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
482 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 
506 aa  207  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
514 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 
504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
499 aa  196  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
513 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
510 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
526 aa  179  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
435 aa  178  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  30.83 
 
 
504 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  28.36 
 
 
507 aa  169  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 
513 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  27.61 
 
 
394 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 
388 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.91 
 
 
227 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10493  hypothetical protein  26.09 
 
 
289 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000931563  normal  0.209074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  25.73 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  23.22 
 
 
428 aa  66.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  25 
 
 
463 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 
435 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  23.83 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 
428 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 
428 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
433 aa  64.3  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
463 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  24.05 
 
 
428 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 
428 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 
428 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 
428 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  22.72 
 
 
436 aa  63.9  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
435 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  25 
 
 
463 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 
428 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
401 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  41.67 
 
 
139 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  24.6 
 
 
431 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 
426 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
431 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 
431 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 
428 aa  62.4  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  25.17 
 
 
465 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
463 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 
427 aa  60.8  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 
431 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 
435 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40083  Rieske iron-sulfur protein of cytochrome b6f  56.1 
 
 
216 aa  60.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  23.3 
 
 
435 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  26.27 
 
 
438 aa  60.1  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 
435 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  23.3 
 
 
435 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  25.59 
 
 
363 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 
435 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
363 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  24.6 
 
 
435 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  25.64 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>