More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3358 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 592 aa  1201    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 		 524 aa  340  5.9999999999999996e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  42.01 
 
 		 513 aa  334  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 520 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 521 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  38.76 
 
 		 604 aa  314  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 		 508 aa  312  9e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  34.95 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  35.35 
 
 		 508 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 		 508 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  34.75 
 
 		 508 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  34.55 
 
 		 508 aa  310  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  34.75 
 
 		 508 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  35.35 
 
 		 508 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 508 aa  308  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  35.15 
 
 		 508 aa  308  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  34.55 
 
 		 508 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  34.55 
 
 		 508 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 513 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  34.79 
 
 		 521 aa  302  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 510 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  40.08 
 
 		 504 aa  297  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 		 507 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.93 
 
 		 479 aa  286  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  33.33 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  33.54 
 
 		 525 aa  281  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 516 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 514 aa  259  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 512 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  35.4 
 
 		 517 aa  249  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 		 506 aa  240  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 526 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 482 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 513 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  34.11 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 506 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  30.74 
 
 		 507 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 499 aa  223  9e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 502 aa  217  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 518 aa  216  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 507 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 		 503 aa  207  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  35.49 
 
 		 499 aa  203  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 510 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 513 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  30.37 
 
 		 504 aa  192  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 388 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.87 
 
 		 227 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 428 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  30.33 
 
 		 429 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 465 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  30.08 
 
 		 428 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 428 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  29.9 
 
 		 428 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 428 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 478 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 427 aa  95.1  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 427 aa  94  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 436 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  26.6 
 
 		 426 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 436 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  26.6 
 
 		 426 aa  92  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 426 aa  92  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 431 aa  92  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 428 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  26.6 
 
 		 426 aa  92  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 426 aa  92  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  26.6 
 
 		 426 aa  92  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  26.6 
 
 		 426 aa  92  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  29.41 
 
 		 430 aa  91.3  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 436 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  26.33 
 
 		 426 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 429 aa  90.5  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 494 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 435 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  26.47 
 
 		 426 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 423 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 		 429 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 433 aa  87.8  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 		 429 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 424 aa  87.8  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 444 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 435 aa  87  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 424 aa  86.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 444 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>