More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1191 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
513 aa  1051    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 
520 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  43.93 
 
 
510 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  44.2 
 
 
508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 
521 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 
508 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  41.6 
 
 
508 aa  438  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  42 
 
 
508 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  41.6 
 
 
508 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  41.6 
 
 
508 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  42 
 
 
508 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  42.6 
 
 
521 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  41.4 
 
 
508 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  41.4 
 
 
508 aa  435  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  43.43 
 
 
507 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  41.9 
 
 
508 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  47.37 
 
 
524 aa  435  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  41.2 
 
 
508 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  41.7 
 
 
508 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  43.36 
 
 
513 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  40.72 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  40.52 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  40.16 
 
 
479 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 
604 aa  386  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  44.92 
 
 
504 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 
516 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 
482 aa  350  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  42.01 
 
 
592 aa  334  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  43.28 
 
 
394 aa  330  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  40.08 
 
 
512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 
508 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  38.11 
 
 
499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  38.78 
 
 
517 aa  300  3e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 
514 aa  295  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 
531 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  39.05 
 
 
506 aa  286  9e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
513 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  36.31 
 
 
504 aa  276  8e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  36.95 
 
 
501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  35.79 
 
 
507 aa  273  5.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 
526 aa  267  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 
435 aa  259  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 
510 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  36.11 
 
 
499 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
507 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 
506 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
502 aa  228  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 
518 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 
503 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
513 aa  216  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.57 
 
 
227 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 
388 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
431 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
431 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  27.99 
 
 
431 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  26.37 
 
 
439 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  26.37 
 
 
439 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 
431 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 
443 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  25.12 
 
 
437 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 
433 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 
425 aa  107  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
436 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
424 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
435 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
444 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 
437 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  26.09 
 
 
438 aa  101  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
444 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 
435 aa  100  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 
425 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  26.2 
 
 
429 aa  99  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 
433 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 
435 aa  98.2  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
425 aa  97.8  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  25.84 
 
 
435 aa  97.1  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 
427 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
424 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
429 aa  96.3  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 
427 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
423 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 
424 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 
453 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 
425 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 
425 aa  94.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 
430 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
430 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  24.81 
 
 
429 aa  94  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
424 aa  94  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 
435 aa  94  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
425 aa  94  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
429 aa  93.6  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>