283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0117 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
518 aa  1049    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  75.3 
 
 
502 aa  796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  62.06 
 
 
504 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  62.06 
 
 
504 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  62.06 
 
 
507 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  47.78 
 
 
517 aa  436  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  45.29 
 
 
506 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  45.03 
 
 
503 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  47.34 
 
 
499 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  42.09 
 
 
501 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 
512 aa  247  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
508 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 
604 aa  238  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
508 aa  233  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  31.26 
 
 
508 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  31.39 
 
 
508 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 
524 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  30 
 
 
508 aa  230  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  31.04 
 
 
508 aa  229  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  30.83 
 
 
508 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
508 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
510 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  30.5 
 
 
508 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  30.5 
 
 
508 aa  227  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  30.43 
 
 
508 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  30.43 
 
 
508 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 
513 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 
508 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 
592 aa  217  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
520 aa  217  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
513 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 
516 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.04 
 
 
479 aa  213  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
521 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  27.35 
 
 
521 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
514 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  27.71 
 
 
525 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  27.5 
 
 
525 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 
504 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 
531 aa  182  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  29.58 
 
 
504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
506 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
499 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
510 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
435 aa  156  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
513 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  26.58 
 
 
507 aa  150  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 
526 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  27.42 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
513 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
388 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
227 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  24.34 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  24.34 
 
 
428 aa  64.7  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10493  hypothetical protein  24 
 
 
289 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000931563  normal  0.209074 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 
433 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
424 aa  60.8  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  26.79 
 
 
424 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.14 
 
 
148 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 
428 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 
432 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
424 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
374 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
434 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 
428 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.83 
 
 
141 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05617  FAD dependent oxidoreductase, putative  23.51 
 
 
417 aa  53.9  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0367368  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 
437 aa  53.9  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  23.84 
 
 
428 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3894  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  46 
 
 
175 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
426 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 
478 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
425 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1693  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  46.67 
 
 
177 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
436 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 
494 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 
494 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  45.45 
 
 
430 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  45.65 
 
 
139 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
423 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 
428 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13358  predicted protein  48.78 
 
 
178 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
494 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40083  Rieske iron-sulfur protein of cytochrome b6f  41.3 
 
 
216 aa  50.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  52.08 
 
 
427 aa  50.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 
960 aa  50.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.62 
 
 
381 aa  50.1  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3187  oxidoreductase, putative  20.53 
 
 
405 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.70562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0385  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  39.13 
 
 
179 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
429 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 
429 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1087  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
425 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0182  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
475 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  38.78 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 
441 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0665  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
475 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.691496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>