More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3393 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  62.03 
 
 
508 aa  683    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  62.03 
 
 
508 aa  679    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
507 aa  1058    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  63.02 
 
 
508 aa  687    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  62.03 
 
 
508 aa  679    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  62.23 
 
 
508 aa  681    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  61.83 
 
 
508 aa  681    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  61.95 
 
 
508 aa  678    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  61.23 
 
 
508 aa  676    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  63.02 
 
 
508 aa  687    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  61.23 
 
 
508 aa  675    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  63.87 
 
 
508 aa  697    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  79.32 
 
 
508 aa  868    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  56.51 
 
 
525 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  56.51 
 
 
525 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 
521 aa  535  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  49.29 
 
 
520 aa  530  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  49.9 
 
 
521 aa  501  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 
510 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  44.85 
 
 
513 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 
513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 
524 aa  385  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.96 
 
 
479 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  38.43 
 
 
604 aa  353  5e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 
512 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 
482 aa  342  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 
516 aa  326  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  37.78 
 
 
504 aa  320  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 
592 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 
508 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 
531 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
514 aa  274  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.82 
 
 
517 aa  273  7e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
526 aa  272  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 
499 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
506 aa  270  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  37.96 
 
 
394 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 
506 aa  262  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  32.04 
 
 
507 aa  256  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  34.73 
 
 
435 aa  256  7e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
513 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 
502 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 
504 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 
504 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
518 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
507 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  31.29 
 
 
504 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
513 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
501 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
499 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
503 aa  206  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 
388 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.35 
 
 
227 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  25.67 
 
 
438 aa  111  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 
430 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 
440 aa  110  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 
429 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 
427 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 
429 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
427 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  25 
 
 
439 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
443 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 
428 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 
429 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  24.65 
 
 
427 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  24.74 
 
 
439 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
427 aa  107  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 
428 aa  107  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 
428 aa  106  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  24.24 
 
 
428 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 
426 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 
437 aa  106  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 
428 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 
435 aa  105  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 
428 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 
427 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
433 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 
428 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 
427 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  23.87 
 
 
429 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 
427 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 
427 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
426 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 
427 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 
428 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  24.62 
 
 
426 aa  103  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1472  hypothetical protein  27.95 
 
 
397 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  24.62 
 
 
426 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
426 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  24.62 
 
 
426 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  24.62 
 
 
426 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  24.62 
 
 
426 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 
427 aa  102  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
435 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1431  hypothetical protein  24.27 
 
 
397 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 
437 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  21.37 
 
 
425 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>