More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1461 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 521 aa  1088    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  56.32 
 
 		 520 aa  614  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  54.81 
 
 		 521 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  52.03 
 
 		 513 aa  565  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  50.81 
 
 		 508 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  49.3 
 
 		 510 aa  542  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 		 507 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  49.09 
 
 		 508 aa  528  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  47.69 
 
 		 508 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  47.69 
 
 		 508 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  47.48 
 
 		 508 aa  521  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  47.48 
 
 		 508 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  47.69 
 
 		 508 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  47.28 
 
 		 508 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  47.28 
 
 		 508 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  47.28 
 
 		 508 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  47.08 
 
 		 508 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  46.08 
 
 		 508 aa  513  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  48.03 
 
 		 525 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  48.58 
 
 		 525 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 		 513 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  43.9 
 
 		 524 aa  458  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  42.68 
 
 		 479 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  39.09 
 
 		 604 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 482 aa  364  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 		 512 aa  353  4e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 516 aa  353  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 504 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 592 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 		 508 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  41.49 
 
 		 394 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 531 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 506 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 506 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 499 aa  281  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 		 514 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 435 aa  276  9e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.33 
 
 		 517 aa  270  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  32.04 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 513 aa  266  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  32.14 
 
 		 504 aa  256  9e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 499 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 501 aa  253  7e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 513 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 504 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 504 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 503 aa  235  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 507 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 518 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.6 
 
 		 227 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3187  oxidoreductase, putative  29.6 
 
 		 405 aa  126  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.70562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3172  oxidoreductase  29.6 
 
 		 405 aa  123  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3195  oxidoreductase  28.64 
 
 		 405 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 424 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 		 436 aa  106  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  22.6 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  22.54 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 432 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 429 aa  100  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 424 aa  100  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  22.54 
 
 		 444 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 434 aa  99.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  21.61 
 
 		 425 aa  97.8  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  25.38 
 
 		 431 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 401 aa  97.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 437 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  22.06 
 
 		 425 aa  97.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 431 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  22.67 
 
 		 444 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2176  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.930184  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  23.84 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 431 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 433 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2410  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 429 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.269083  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1472  hypothetical protein  23.23 
 
 		 397 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  26.28 
 
 		 429 aa  94.4  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1938  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 429 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 428 aa  93.6  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1233  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 		 397 aa  93.6  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 		 433 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  25.96 
 
 		 424 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 		 435 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  26.49 
 
 		 427 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2421  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 429 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347894  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 424 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 435 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 435 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>