More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0388 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  98.62 
 
 
504 aa  987    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
507 aa  1031    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  63.83 
 
 
502 aa  649    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  98.62 
 
 
504 aa  987    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  62.06 
 
 
518 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  50.79 
 
 
517 aa  444  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  47.45 
 
 
506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  46.11 
 
 
499 aa  392  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  42.83 
 
 
501 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 
503 aa  372  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
513 aa  257  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  33.4 
 
 
508 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  33.4 
 
 
508 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 
524 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
510 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  32.59 
 
 
508 aa  244  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  31.83 
 
 
508 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 
512 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  32.72 
 
 
508 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  32.66 
 
 
508 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  32.39 
 
 
508 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  32.39 
 
 
508 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  32.39 
 
 
508 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
508 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
508 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
513 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 
604 aa  236  7e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.82 
 
 
479 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
508 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
507 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
520 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
521 aa  228  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 
592 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  28.87 
 
 
521 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 
516 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 
514 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 
504 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 
506 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  28.94 
 
 
525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  28.72 
 
 
525 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
508 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 
499 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 
531 aa  190  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
510 aa  186  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
513 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
526 aa  170  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
435 aa  167  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  29.43 
 
 
504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  29.7 
 
 
394 aa  160  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 
513 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  26.78 
 
 
507 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.6 
 
 
227 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10493  hypothetical protein  26.47 
 
 
289 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000931563  normal  0.209074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  25.45 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  26.43 
 
 
438 aa  67  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3794  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  25.19 
 
 
439 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05617  FAD dependent oxidoreductase, putative  24.94 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0367368  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
426 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 
437 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
432 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  25.31 
 
 
431 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 
436 aa  60.5  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 
432 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 
401 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 
402 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
434 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.02 
 
 
148 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  25.32 
 
 
411 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  22.95 
 
 
428 aa  57.4  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  22.95 
 
 
428 aa  57.8  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 
445 aa  57.4  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 
431 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  25.42 
 
 
440 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  21.17 
 
 
401 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2579  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
431 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612583  normal  0.495768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  23.93 
 
 
431 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 
427 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 
427 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
465 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 
430 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.51 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.51 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.51 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  23.14 
 
 
433 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  37.82 
 
 
433 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  25.59 
 
 
428 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 
434 aa  54.7  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.51 
 
 
426 aa  54.7  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  33.63 
 
 
426 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 
426 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  33.63 
 
 
426 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  34.07 
 
 
430 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>