More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0172 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
513 aa  1071    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  52.03 
 
 
521 aa  545  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  49.61 
 
 
520 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  50 
 
 
521 aa  502  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  46.65 
 
 
510 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  45.49 
 
 
508 aa  472  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  45.49 
 
 
508 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  45.49 
 
 
508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  44.89 
 
 
508 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  44.89 
 
 
508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  45.09 
 
 
508 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  45.09 
 
 
508 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  44.78 
 
 
508 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  45.09 
 
 
508 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  45.56 
 
 
508 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  44.69 
 
 
508 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 
508 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  46.09 
 
 
525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  46.15 
 
 
525 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  44.85 
 
 
507 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  43.36 
 
 
513 aa  431  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  42.35 
 
 
524 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.1 
 
 
479 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  40.25 
 
 
482 aa  332  8e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  36.22 
 
 
604 aa  330  5.0000000000000004e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  38.43 
 
 
504 aa  322  9.000000000000001e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 
516 aa  312  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 
512 aa  305  9.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 
592 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  38.13 
 
 
435 aa  300  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
508 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  39.43 
 
 
394 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
506 aa  257  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 
506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
514 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 
513 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
531 aa  243  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.49 
 
 
517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
526 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
501 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
499 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
504 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
504 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  32.52 
 
 
504 aa  227  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
507 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  27.77 
 
 
502 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  30.67 
 
 
507 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 
499 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 
510 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
518 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
513 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
503 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
388 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
227 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 
425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 
443 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3195  oxidoreductase  25.18 
 
 
405 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3172  oxidoreductase  25.66 
 
 
405 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3187  oxidoreductase, putative  25.18 
 
 
405 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.70562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1472  hypothetical protein  26.6 
 
 
397 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
401 aa  96.7  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1211  oxidoreductase  29.77 
 
 
397 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1431  hypothetical protein  29.39 
 
 
397 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  24.02 
 
 
438 aa  93.6  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  23.34 
 
 
430 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  27.21 
 
 
461 aa  92.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 
426 aa  91.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
424 aa  91.3  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
444 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  22.96 
 
 
435 aa  90.9  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
428 aa  90.9  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
482 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1209  oxidoreductase  28.57 
 
 
397 aa  90.1  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 
423 aa  90.1  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
444 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
402 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  23.38 
 
 
439 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
425 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1233  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
397 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 
430 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  24.76 
 
 
437 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
444 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
429 aa  87.4  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
426 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  22.66 
 
 
436 aa  87.4  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  26.6 
 
 
468 aa  87.4  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  26.98 
 
 
468 aa  87  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 
425 aa  86.7  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
427 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 
433 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 
436 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
437 aa  86.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  26.98 
 
 
468 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  22.38 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  30.71 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  25.13 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1332  hypothetical protein  27.86 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  25.57 
 
 
430 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>