More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5049 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 513 aa  1070    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  50.5 
 
 		 507 aa  497  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  45.9 
 
 		 531 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 		 513 aa  311  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 526 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 		 508 aa  302  9e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 514 aa  300  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 		 508 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 499 aa  293  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  34.29 
 
 		 508 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  34.88 
 
 		 508 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  34.88 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  34.88 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  34.09 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  34.88 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 		 510 aa  290  6e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  34.25 
 
 		 508 aa  289  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  34.25 
 
 		 508 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 604 aa  288  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  34.46 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 		 506 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 524 aa  283  5.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 521 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  32.81 
 
 		 504 aa  276  6e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 512 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  32.13 
 
 		 521 aa  270  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  32.61 
 
 		 525 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 		 507 aa  264  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.97 
 
 		 525 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 510 aa  259  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 592 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 513 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 508 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.45 
 
 		 479 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 504 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 482 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 504 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 504 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.72 
 
 		 517 aa  196  7e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 507 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 503 aa  193  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 518 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 499 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  29.59 
 
 		 394 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.57 
 
 		 227 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 501 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 388 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  25.63 
 
 		 427 aa  124  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 402 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 409 aa  104  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10493  hypothetical protein  33.05 
 
 		 289 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000931563  normal  0.209074 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 402 aa  97.8  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 411 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 426 aa  94  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  25.27 
 
 		 426 aa  94  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  24.54 
 
 		 426 aa  94  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 435 aa  93.6  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 		 426 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  23.04 
 
 		 482 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  21.27 
 
 		 401 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  25.27 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 428 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0863  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 430 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 428 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  25 
 
 		 426 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 426 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  25 
 
 		 426 aa  92  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  25 
 
 		 426 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 434 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  25 
 
 		 426 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 428 aa  91.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 428 aa  90.1  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 429 aa  90.1  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 		 430 aa  90.1  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  24.04 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 427 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 		 427 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 431 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  21.14 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>