More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2687 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  810    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 520 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 524 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  42.04 
 
 		 521 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 		 521 aa  293  5e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  39.43 
 
 		 513 aa  281  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 		 508 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  37.82 
 
 		 510 aa  265  7e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 516 aa  262  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 508 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  38.32 
 
 		 525 aa  253  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  38.32 
 
 		 525 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 		 507 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.39 
 
 		 479 aa  245  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  32.99 
 
 		 508 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  32.99 
 
 		 508 aa  242  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  33.59 
 
 		 508 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  33.59 
 
 		 508 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  33.33 
 
 		 508 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  33.33 
 
 		 508 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  33.07 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  34.11 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  34.11 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 592 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 604 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 512 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 504 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 499 aa  202  8e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 482 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 514 aa  186  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 508 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  29.12 
 
 		 504 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 513 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 531 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 526 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.14 
 
 		 517 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 506 aa  159  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  31.75 
 
 		 507 aa  156  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 504 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 504 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 501 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 518 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 503 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 443 aa  113  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 429 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 424 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 		 429 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  25 
 
 		 429 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 429 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2176  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.930184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1938  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2421  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  22.67 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  24.55 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2410  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 429 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.269083  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 		 429 aa  93.2  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 444 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 429 aa  92.8  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 		 444 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 425 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  22.14 
 
 		 425 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 437 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 435 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 440 aa  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 		 428 aa  89.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  24.19 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 437 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  28.57 
 
 		 429 aa  86.7  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 424 aa  86.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 435 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  22.38 
 
 		 465 aa  86.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  23.29 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  27.35 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>