More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2065 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  100 
 
 		 507 aa  1061    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  50.5 
 
 		 513 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  46.53 
 
 		 531 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 513 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 508 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 499 aa  292  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 508 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 510 aa  291  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 514 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 		 508 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 520 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 526 aa  286  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  34.58 
 
 		 508 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  34.38 
 
 		 508 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  34.58 
 
 		 508 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  33.75 
 
 		 508 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  33.75 
 
 		 508 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  34.17 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  34.38 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  34.17 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  33.96 
 
 		 508 aa  281  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  35.32 
 
 		 521 aa  280  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 521 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  31.73 
 
 		 504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 524 aa  274  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 507 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.89 
 
 		 525 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 506 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.69 
 
 		 525 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 604 aa  255  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 513 aa  250  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 592 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.6 
 
 		 479 aa  243  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 516 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 482 aa  229  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 508 aa  226  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.08 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  32.8 
 
 		 394 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 502 aa  178  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 501 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 504 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 504 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.26 
 
 		 227 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 507 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 388 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 513 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 401 aa  113  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 402 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  25.97 
 
 		 438 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  24.38 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 432 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  24.68 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  25.13 
 
 		 431 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  25.44 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 401 aa  97.8  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  25.69 
 
 		 439 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10493  hypothetical protein  26.79 
 
 		 289 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000931563  normal  0.209074 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 431 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  23.46 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 434 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 409 aa  94.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 428 aa  94.4  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 428 aa  94.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 428 aa  94  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 437 aa  94  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 428 aa  93.6  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  23.68 
 
 		 424 aa  93.6  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 429 aa  93.6  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 		 436 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 435 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 432 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 428 aa  90.5  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  24.46 
 
 		 429 aa  90.5  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 435 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 428 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 428 aa  90.1  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 		 428 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 		 478 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 411 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>