More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2645 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
526 aa  1092    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  47.32 
 
 
514 aa  488  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  41.63 
 
 
506 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 
510 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 
531 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 
604 aa  279  9e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
513 aa  276  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
524 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 
513 aa  267  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
508 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  33.78 
 
 
508 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  33.33 
 
 
508 aa  260  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  33.59 
 
 
508 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  33.52 
 
 
508 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  33.59 
 
 
508 aa  259  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
508 aa  259  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  32.95 
 
 
508 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  32.95 
 
 
508 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  33.14 
 
 
508 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  33.14 
 
 
508 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  34.04 
 
 
507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
507 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
508 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
510 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
499 aa  247  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 
512 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
513 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  31.38 
 
 
504 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 
508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.04 
 
 
479 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 
520 aa  231  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 
516 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 
521 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.33 
 
 
525 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.14 
 
 
525 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 
482 aa  203  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  29.86 
 
 
521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 
504 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.19 
 
 
517 aa  186  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
506 aa  179  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
227 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  29.06 
 
 
394 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
507 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
504 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
504 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
513 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
502 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10493  hypothetical protein  36.36 
 
 
289 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000931563  normal  0.209074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 
518 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
499 aa  144  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
503 aa  144  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 
388 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
435 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  25.83 
 
 
482 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
424 aa  104  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
401 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.33 
 
 
455 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  24.65 
 
 
427 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  27.59 
 
 
424 aa  97.8  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
401 aa  97.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  26.46 
 
 
424 aa  97.1  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
425 aa  94  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  26.1 
 
 
455 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 
443 aa  92.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 
428 aa  92.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
424 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 
437 aa  89.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
428 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
425 aa  89.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  27 
 
 
428 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 
440 aa  88.2  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 
482 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 
432 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 
428 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  24.87 
 
 
439 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 
453 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  24.61 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 
453 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 
436 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.62 
 
 
139 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
428 aa  84  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1211  oxidoreductase  24.8 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  22.17 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  24.19 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
429 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 
429 aa  81.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  22.57 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.56 
 
 
138 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4319  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
399 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 
425 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 
435 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  24.61 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>