More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4610 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 409 aa  819    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  52.01 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  40.2 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  39.3 
 
 		 411 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  38.94 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0863  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 430 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3794  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4319  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 402 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3974  hypothetical protein  28.97 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1211  oxidoreductase  28.21 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05617  FAD dependent oxidoreductase, putative  32 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0367368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1232  hypothetical protein  28.14 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1209  oxidoreductase  28.39 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1332  hypothetical protein  28.14 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1407  hypothetical protein  28.14 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1431  hypothetical protein  28.21 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3172  oxidoreductase  27.53 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3195  oxidoreductase  27.27 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1233  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1370  hypothetical protein  28.39 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1472  hypothetical protein  27.96 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3187  oxidoreductase, putative  27.2 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.70562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 513 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.53 
 
 		 479 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  27.74 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 		 526 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  23.83 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 513 aa  80.1  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  22.33 
 
 		 508 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  22.28 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  22.22 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  23.34 
 
 		 508 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  22.28 
 
 		 508 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 531 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  23.93 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  25.42 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 604 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  22.69 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  23.83 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  22.08 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  21.38 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  23.27 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  22.73 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 508 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 		 520 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  24.35 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  20.15 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 514 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  20.15 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5122  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1063  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  23.96 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 		 507 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  23.9 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 464 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 424 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1938  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2176  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.930184  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  25.65 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  25.12 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  23.41 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  21.63 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2421  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347894  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2410  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.269083  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  21.55 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  23.19 
 
 		 521 aa  63.2  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  24.21 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>