More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4319 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4319  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
399 aa  830    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  42.75 
 
 
401 aa  356  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 
401 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 
402 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 
401 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05617  FAD dependent oxidoreductase, putative  33.17 
 
 
417 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0367368  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 
402 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3172  oxidoreductase  34.76 
 
 
405 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3187  oxidoreductase, putative  35.01 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.70562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3195  oxidoreductase  34.76 
 
 
405 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  31.25 
 
 
427 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 
432 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 
411 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
409 aa  205  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1431  hypothetical protein  29.22 
 
 
397 aa  202  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1472  hypothetical protein  29.47 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1233  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 
397 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1211  oxidoreductase  28.97 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3974  hypothetical protein  28.72 
 
 
397 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3794  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 
411 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0863  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
430 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1407  hypothetical protein  27.96 
 
 
397 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1370  hypothetical protein  28.89 
 
 
398 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1232  hypothetical protein  27.71 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1332  hypothetical protein  27.71 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1209  oxidoreductase  27.46 
 
 
397 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
420 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
428 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  26.95 
 
 
479 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
526 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 
520 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1063  FAD dependent oxidoreductase  22.35 
 
 
437 aa  96.7  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
508 aa  96.3  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 
429 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 
514 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
508 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
510 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  21.61 
 
 
462 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 
473 aa  94  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 
429 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 
429 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 
425 aa  94  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  22.56 
 
 
429 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  24.75 
 
 
508 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 
431 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  22.39 
 
 
436 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 
434 aa  92  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 
508 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  24.74 
 
 
424 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 
431 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  24.82 
 
 
466 aa  90.1  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  21.5 
 
 
462 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5122  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 
460 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  24.42 
 
 
508 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  21.5 
 
 
462 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  24.42 
 
 
508 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 
506 aa  89.7  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  24.16 
 
 
508 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 
429 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  23.66 
 
 
431 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 
510 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1813  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 
429 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00738573  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  21.5 
 
 
462 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 
466 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  21.5 
 
 
521 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  23.94 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  22.36 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  21.35 
 
 
491 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  23.75 
 
 
463 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  22.63 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  24.68 
 
 
508 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  22.74 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  24.68 
 
 
508 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  24.42 
 
 
508 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  21.91 
 
 
441 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
436 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 
444 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 
483 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 
442 aa  86.7  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  21.88 
 
 
431 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  24.16 
 
 
508 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  23.9 
 
 
508 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 
425 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 
463 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  21.26 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 
424 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 
424 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  23.25 
 
 
463 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  20.91 
 
 
443 aa  84  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  21.68 
 
 
435 aa  84  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
507 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  20.11 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 
463 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  22.43 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  21.48 
 
 
430 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4020  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 
429 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471109  normal  0.716709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  21.72 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>